По неподтвержденной, но логичной версии, ИКС — прототип улетевшей героини песни. "ИКС" — название парикмахерской в Кемерово. Что мы заменили на ИКС?
Стриж.
Андрей Макаревич опровергает предположения, что песня "Она любила летать по ночам" описывает его отношения с радиоведущей Ксенией Стриж, но птичья фамилия Ксении и тот факт, что песня написана через несколько лет после их расставания, сделали эту версию популярной в народе. В парикмахерской "Стриж" делают стрижки.