Одна — символ Иисуса Христа, три являются знамением трех ипостасей Святой Троицы, пять символизируют Иисуса Христа и четырех евангелистов, семь обозначают семь таинств, семь Вселенских Соборов, семь даров Святого Духа, девять знаменуют Девять чинов ангельских, тринадцать символизируют Христа и двенадцать апостолов. В "Двенадцати стульях" их 40, а в "Золотом теленке" 36. Чего?
Глав.
Глава — в изображении архитектурных сооружений: наружное декоративное завершение на барабанах церквей в форме шлема, луковицы, обычно венчаемых крестом. Количество глав на храме имеет символическое значение, часть которых перечислена в вопросе.